恒溫培養(yǎng)搖床溫度對發(fā)酵的影響是多方面的，微生物發(fā)酵即是指利用微生物，在適宜的條件下，將原料經(jīng)過特定的代謝途徑轉(zhuǎn)化為人類所需要的產(chǎn)物的過程。微生物發(fā)酵生產(chǎn)水平主要取決于菌種本身的遺傳特性和培養(yǎng)條件。
一般來說影響菌類的產(chǎn)量的條件有：碳源、pH和培養(yǎng)時間、發(fā)酵溫度，搖床轉(zhuǎn)速振幅等。其中碳源PH值等因素靠培養(yǎng)基來決定，發(fā)酵溫度和搖床轉(zhuǎn)速振幅就需要恒溫培養(yǎng)搖床來實現(xiàn)了。
1、溫度對發(fā)酵產(chǎn)生的孢數(shù)和活菌數(shù)有十分顯著的影響。微生物一般的存活溫度在20到35攝氏度，過高過低的溫度都會導致菌類失活，甚至死亡。從酶反應動力學來看，溫度升高，反應速度加大，生長代謝加快，產(chǎn)物生成提前。但是，溫度愈高酶失活愈快，菌體易于衰老，影響產(chǎn)物的生成。
2、同一菌類生長和積累代謝產(chǎn)物所需的溫度也不同。比如，適合青霉素產(chǎn)生菌生長的溫度為30℃，而產(chǎn)生青霉素的適溫度為25℃。黑曲霉生長溫度為37℃，產(chǎn)生糖化酶和檸檬酸時都在32～34℃。這就需要根據(jù)生產(chǎn)所需產(chǎn)物的不同來調(diào)節(jié)溫度，以及在生產(chǎn)的不同階段設定不同的溫度。
3、溫度還能影響酶系組成及酶的特性。例如55℃恒溫培養(yǎng)搖床所產(chǎn)生的酶在90℃保持60min，其剩余活性為88%～99%;在35℃培養(yǎng)所產(chǎn)生的酶，經(jīng)相同條件處理，剩余活性僅有6%-10%。
4、不同的溫度對菌類產(chǎn)生的代謝產(chǎn)物也有不同的影響。如利用金霉素鏈霉菌NRRLB-1287進行四環(huán)素發(fā)酵，當發(fā)酵溫度設置在30℃以下，會導致金霉素合成增多。當我們提高發(fā)酵溫度時，則有利于四環(huán)素的合成。在35℃時，金霉素鏈霉菌只產(chǎn)出四環(huán)素，幾乎停止合成金霉素。
5、溫度還會影響發(fā)酵液的物理性質(zhì)，如發(fā)酵液的黏度、基質(zhì)和氧在發(fā)酵液中的溶解度和傳遞速率、某些基質(zhì)的分解和吸收速率等。發(fā)酵溫度通過對上述條件的影響，從而影響發(fā)酵的動力學特性和產(chǎn)物的生物合成。
因此，在發(fā)酵過程中需要維持適當?shù)臏囟?，才能使菌體生長和代謝產(chǎn)物的合成順利進行。在選擇恒溫培養(yǎng)搖床時，對溫度的精確控制就成為選擇的重要參數(shù)之一。
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